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Liberado un nuevo conjunto de casos de pacientes en el Breast Cancer Digital Repository

julio 2 | Almacenamiento de datos, Biomedicina, SALUD Y SOCIEDAD | por | Sin Comentarios

CETA-Ciemat, en colaboración con el Instituto de Ingeniería Mecánica y la Facultad de Medicina de la Universidad de Oporto, enriquece el Repositorio Digital del Cáncer de Mama (BCDR, por sus siglas en inglés) con nuevos casos de lesiones biopsiadas e imágenes de alta resolución. El Repositorio Digital del Cáncer de Mama ha sido desarrollado bajo el marco de colaboración que mantienen estas tres instituciones.

Este conjunto de casos forma parte del llamado Full Field Digital Mammography-based Repository o BCDR-DM. Este repositorio está todavía en construcción y su contenido se irá enriqueciendo con nuevos casos periódicamente. Los investigadores y especialistas pueden acceder a un total de 237 nuevos casos de pacientes con 408 lesiones, incluyendo un total de 818 sementaciones. Junto con estos nuevos casos, se ha liberado un nuevo dataset de pruebas (BCDR-D01), extraído del BCDR-DM, formado por 79 lesiones representativas de masas: 49 benignas y 30 malignas (avaladas por biopsia), conteniendo un total de 143 vectores de características (86 instancias asociadas a las lesiones benignas y 57 a las malignas). En este dataset están disponibles las siguientes modalidades:

  • Datos clínicos y características de las imágenes precalculadas: Esta modalidad está preparada para ejecutar experimentos de machine learning (nombre: bcdr_d01_features formato: csv).
  • Datos clínicos y contorno de las lesiones: Esta modalidad permite a los usuarios calcular nuevos descriptores de las imágenes. También se incluye un ejemplo de uso en MATLAB (nombre: bcdr_d01_outlines formato: csv).

Adicionalmente, se ha actualizado el contenido de la base de datos de imágenes de baja resolución o BCDR-F01 (versión 1.1), habiéndose actualizado de los campos edad y densidad. Este dataset también está disponible para descarga. Además, esta nueva versión del BCDr-F01 incluye imágenes de la vista craneo-caudal y oblicuo-lateral para todas las lesiones del dataset.

Para acceder a los archivos es necesario la firma del documento del acuerdo de no divulgación y su envío por correo electrónico a la dirección bcdr@inegi.up.pt. Alternativamente se puede enviar por fax o correo ordinario a la dirección que aparece de contacto en la web del repositorio BCDR.

Más información en: http://bcdr.ceta-ciemat.es, http://www.bcdr.eu

 

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